實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀是分子生物學(xué)中一種強(qiáng)大的工具,其用于定量檢測(cè)特定DNA或RNA分子的擴(kuò)增過(guò)程的技術(shù)。實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀則是執(zhí)行這一技術(shù)的平臺(tái),它通過(guò)增加一個(gè)熒光信號(hào)采集系統(tǒng)和計(jì)算機(jī)分析處理系統(tǒng),實(shí)現(xiàn)了對(duì)PCR擴(kuò)增過(guò)程的實(shí)時(shí)監(jiān)控。在擴(kuò)增時(shí),引物利用同位素或熒光素進(jìn)行標(biāo)記,與熒光探針和模板特異性結(jié)合進(jìn)行擴(kuò)增。擴(kuò)增信號(hào)通過(guò)實(shí)時(shí)采集系統(tǒng)輸送到計(jì)算機(jī)進(jìn)行分析處理,最終得出量化的實(shí)時(shí)結(jié)果。
實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀其核心組成部分相互協(xié)作,共同實(shí)現(xiàn)核酸的擴(kuò)增、檢測(cè)與數(shù)據(jù)分析。以下是qPCR儀的主要組成部分及其功能詳解:
一、熱循環(huán)系統(tǒng)(Thermal Cycler)
熱循環(huán)系統(tǒng)是qPCR儀的核心模塊,負(fù)責(zé)精確控制PCR反應(yīng)的溫度變化,實(shí)現(xiàn)DNA的變性、退火和延伸三個(gè)關(guān)鍵步驟。
溫度控制模塊
半導(dǎo)體加熱/制冷片:通過(guò)帕爾貼效應(yīng)快速升降溫,實(shí)現(xiàn)溫度的精確控制(通常精度達(dá)±0.1℃)。
溫度傳感器:實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)反應(yīng)模塊的溫度,反饋至控制系統(tǒng)以調(diào)整加熱/制冷功率。
熱蓋:防止反應(yīng)管頂部冷凝,避免蒸發(fā)導(dǎo)致的體積變化和信號(hào)干擾。
反應(yīng)模塊設(shè)計(jì)
樣品槽:通常為96孔板、384孔板或單管/8聯(lián)管格式,適配不同實(shí)驗(yàn)規(guī)模。
均勻加熱:通過(guò)優(yōu)化熱傳導(dǎo)設(shè)計(jì)(如金屬塊或硅基材料),確保所有樣品孔溫度一致,減少邊緣效應(yīng)。
二、光學(xué)檢測(cè)系統(tǒng)(Optical Detection System)
光學(xué)檢測(cè)系統(tǒng)負(fù)責(zé)實(shí)時(shí)捕獲PCR反應(yīng)中的熒光信號(hào),并將其轉(zhuǎn)化為數(shù)字信號(hào)供后續(xù)分析。
激發(fā)光源
LED或激光:提供特定波長(zhǎng)的激發(fā)光(如488nm用于FAM染料,550nm用于HEX/VIC染料),激發(fā)熒光基團(tuán)。
多波長(zhǎng)設(shè)計(jì):支持多種熒光染料(如SYBR Green、ROX、Cy5)的同步檢測(cè),實(shí)現(xiàn)多靶標(biāo)分析。
熒光信號(hào)采集
光學(xué)濾光片:分離激發(fā)光和發(fā)射光,減少背景噪聲。
光電倍增管(PMT)或CCD相機(jī):高靈敏度檢測(cè)熒光信號(hào),支持單孔或整板掃描。
光路設(shè)計(jì):采用光纖傳導(dǎo)或共聚焦光學(xué)系統(tǒng),提高信號(hào)采集效率。
檢測(cè)模式
終點(diǎn)法檢測(cè):在PCR反應(yīng)結(jié)束后測(cè)量熒光信號(hào),適用于定性分析。
實(shí)時(shí)動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè):在每個(gè)循環(huán)的延伸階段末采集信號(hào),生成擴(kuò)增曲線,用于定量分析。
三、控制系統(tǒng)與軟件(Control System&Software)
控制系統(tǒng)與軟件是qPCR儀的“大腦”,負(fù)責(zé)協(xié)調(diào)硬件運(yùn)行、數(shù)據(jù)采集與分析。
硬件控制
微處理器:執(zhí)行溫度控制程序、光學(xué)檢測(cè)指令及數(shù)據(jù)傳輸。
用戶界面:觸摸屏或電腦軟件,支持實(shí)驗(yàn)參數(shù)設(shè)置(如溫度、時(shí)間、循環(huán)數(shù))、運(yùn)行監(jiān)控及結(jié)果導(dǎo)出。
數(shù)據(jù)分析軟件
基線校正:自動(dòng)扣除背景熒光,修正基線漂移。
閾值設(shè)定:根據(jù)噪聲水平確定熒光閾值,計(jì)算Ct值(循環(huán)閾值)。
定量分析:通過(guò)標(biāo)準(zhǔn)曲線法或比較Ct法(ΔΔCt法)計(jì)算靶基因的初始拷貝數(shù)。
熔解曲線分析:針對(duì)SYBR Green等染料,通過(guò)監(jiān)測(cè)熔解溫度(Tm)區(qū)分特異性產(chǎn)物與非特異性產(chǎn)物。
多報(bào)告基因分析:支持多通道熒光信號(hào)的同步分析,實(shí)現(xiàn)基因表達(dá)多維度比較。
四、反應(yīng)體系與耗材(Reaction System&Consumables)
反應(yīng)體系與耗材是qPCR實(shí)驗(yàn)的物質(zhì)基礎(chǔ),直接影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果。
反應(yīng)體系組成
模板DNA/RNA:待擴(kuò)增的核酸樣本。
引物(Primers):特異性結(jié)合靶序列的寡核苷酸,定義擴(kuò)增區(qū)域。
探針(Probes):如TaqMan探針,攜帶熒光報(bào)告基團(tuán)和淬滅基團(tuán),實(shí)現(xiàn)實(shí)時(shí)信號(hào)檢測(cè)。
熒光染料:如SYBR Green,非特異性結(jié)合雙鏈DNA,適用于未知序列擴(kuò)增。
酶制劑:耐熱DNA聚合酶(如Taq酶)、逆轉(zhuǎn)錄酶(用于RT-qPCR)。
緩沖液與dNTPs:維持反應(yīng)環(huán)境穩(wěn)定,提供原料。
耗材選擇
反應(yīng)管:低吸附、耐高溫的聚丙烯管,減少核酸損失。
光學(xué)膜:密封反應(yīng)管,防止蒸發(fā)同時(shí)允許熒光透射。
標(biāo)準(zhǔn)品:已知濃度的核酸樣本,用于繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線。
五、輔助模塊(Auxiliary Modules)
部分qPCR儀配備輔助模塊,以擴(kuò)展功能或提升用戶體驗(yàn)。
梯度PCR功能
通過(guò)獨(dú)立控制不同區(qū)域的溫度,實(shí)現(xiàn)退火溫度的梯度設(shè)置,優(yōu)化引物設(shè)計(jì)。
自動(dòng)化進(jìn)樣系統(tǒng)
集成機(jī)械臂或液體處理工作站,實(shí)現(xiàn)高通量樣本的自動(dòng)加載與反應(yīng)體系構(gòu)建。
遠(yuǎn)程監(jiān)控與云平臺(tái)
支持實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)云端存儲(chǔ)與共享,便于多中心協(xié)作與長(zhǎng)期追蹤。